Η Β3 Διεύθυνση Διμερών Οικονομικών Σχέσεων με Ευρωπαϊκές χώρες, χώρες Βόρειας, Κεντρικής και Νότιας Αμερικής και Καραϊβικής είναι αρμόδια για:

α) την παρακολούθηση και προώθηση των διμερών οικονομικών και εμπορικών σχέσεων της Χώρας, σε συνεργασία με τις αντίστοιχες πρεσβευτικές και προξενικές Αρχές και τα Γραφεία Ο.Ε.Υ. και άλλες υπηρεσίες και φορείς του δημοσίου και ιδιωτικού τομέα, καθώς και τη μελέτη και υποβολή προτάσεων με σκοπό την ανάπτυξη των διμερών οικονομικών και εμπορικών σχέσεων με τις χώρες αρμοδιότητάς της,

β) την παρακολούθηση των ευρωπαϊκών και διεθνών χρηματοδοτικών και αναπτυξιακών προγραμμάτων και προγραμμάτων συνεργασίας κατά χώρα,

γ) τη μελέτη και υποβολή προτάσεων στη Β’ Γενική Διεύθυνση με σκοπό την ανάπτυξη των διμερών οικονομικών και εμπορικών σχέσεων για την περιοχή ευθύνης της,

δ) την προπαρασκευή των εργασιών των διακρατικών επιτροπών, τη συμμετοχή σε αυτές, καθώς και την ευθύνη των διμερών διαπραγματεύσεων,

ε) τη διαμόρφωση του θεσμικού πλαισίου οικονομικής συνεργασίας δια μέσου της σύναψης συμφωνιών και την παρακολούθηση και τον χειρισμό θεμάτων εμπορικής, οικονομικής και τεχνικής συνεργασίας, στ) την παρακολούθηση και τον χειρισμό διασυνοριακών θεμάτων, σε συνεργασία με τους συναρμόδιους φορείς, ζ) την παρακολούθηση περιφερειακών πολιτικών της Ευρωπαϊκής Ένωσης κατά χώρα.

Η Β3 Διεύθυνση Διμερών Οικονομικών Σχέσεων με Ευρωπαϊκές χώρες, χώρες Βόρειας, Κεντρικής και Νότιας Αμερικής και Καραϊβικής διαρθρώνεται σε δύο Τμήματα:

α) Τμήμα Ι Διμερών Οικονομικών Σχέσεων με Ευρωπαϊκές χώρες

β) Τμήμα ΙΙ Διμερών Οικονομικών Σχέσεων με χώρες Βόρειας, Κεντρικής και Νότιας Αμερικής και Καραϊβικής. 

Το Τμήμα Ι Διμερών Οικονομικών Σχέσεων με Ευρωπαϊκές χώρες είναι αρμόδιο για:

α) την προώθηση των διμερών οικονομικών και εμπορικών σχέσεων με τις εξής χώρες: Άγιος Μαρίνος, Ανδόρα, Αυστρία, Βατικανό, Βέλγιο, Γαλλία, Γερμανία, Δανία, Ελβετία, Εσθονία, Ηνωμένο Βασίλειο, Ιρλανδία, Ισλανδία, Ισπανία, Ιταλία, Κύπρος, Λετονία, Λιθουανία, Λιχτενστάιν, Λουξεμβούργο, Μάλτα, Μονακό, Νορβηγία, Ολλανδία, Ουγγαρία, Πολωνία, Πορτογαλία, Σλοβακία, Σλοβενία, Σουηδία, Τσεχία και Φινλανδία, β) την παρακολούθηση όλων των προγραμμάτων συνεργασίας που αναπτύσσονται στις χώρες ευθύνης του. 

Το Τμήμα ΙΙ Διμερών Οικονομικών Σχέσεων με χώρες Βόρειας, Κεντρικής και Νότιας Αμερικής και Καραϊβικής, είναι αρμόδιο για:

α) την προώθηση των διμερών οικονομικών και εμπορικών σχέσεων με τις εξής χώρες: Ηνωμένες Πολιτείες Αμερικής, Καναδά, Μεξικό, Αϊτή, Αντίγκουα και Μπαρμπούντα, Γουατεμάλα, Γρενάδα, Κοινοπολιτεία Ντομίνικα (Δομίνικα), Δομινικανή Δημοκρατία, Ελ Σαλβαντόρ, Τζαμάικα (Ιαμαϊκή), Κόστα-Ρίκα, Κούβα, Μεξικό, Μπαρμπάντος, Μπαχάμες, Μπελίζ, Νικαράγουα, Ονδούρα, Παναμά, Άγιο Βικέντιο και Γρεναδίνες, Άγιο Χριστόφορο και Νέβις, Σάντα Λουτσία, Τρινιντάντ και Τομπάγκο, Αργεντινή, Βενεζουέλα, Βολιβία Βραζιλία, Γουϊάνα, Ισημερινό, Κολομβία, Ουρουγουάη, Παραγουάη, Περού, Σουρινάμ και Χιλή, β) την παρακολούθηση όλων των προγραμμάτων συνεργασίας που αναπτύσσονται στις χώρες ευθύνης του